水產養殖細菌病原體數據庫:利用環境DNA在沿海水域進行病原體監測和篩選
參與成員: 程金平 博士, 劉紅斌 教授
為了防止經濟和公共衛生問題的產生,需要改進監測平台以應對沿海和海洋養殖區域中不同病原體增加的頻率。配備最新知識和分類的可訪問數據庫對於檢測和篩選環境病原體至關重要。本研究從超過3000份相關報告中建立了一個水產養殖細菌病原體數據庫,彙編了影響水產養殖的210多種細菌病原物種。將該數據庫應用於香港沿海和海洋養殖水域的環境DNA代碼組監測數據中,可以有效地在一年內描述區域病原體組成,提高對新潛在病原靶標的識別能力。結果突出顯示了與水產養殖活動和相關無機氮負荷相關的潛在病原體豐度的增加,主要是由於異常乾燥的冬季季節中弧菌的富集。該數據庫使得基於環境DNA的方法在沿海海洋病原體監測中更具應用價值,有益於全球水資源管理和水產養殖發展。
參考:
Lo, L.S., Liu, X., Liu, H., Shao, M., Qian, P.Y., Cheng, J., (2023). Aquaculture bacterial pathogen database: Pathogen monitoring and screening in coastal waters using environmental DNA. Water Research X, 20, 100194. (impact factor: 9.365)
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