参与成员: 程金平 博士, 刘红斌 教授

为了防止经济和公共卫生问题的产生，需要改进监测平台以应对沿海和海洋养殖区域中不同病原体增加的频率。配备最新知识和分类的可访问数据库对于检测和筛选环境病原体至关重要。本研究从超过3000份相关报告中建立了一个水产养殖细菌病原体数据库，汇编了影响水产养殖的210多种细菌病原物种。将该数据库应用于香港沿海和海洋养殖水域的环境DNA代码组监测数据中，可以有效地在一年内描述区域病原体组成，提高对新潜在病原靶标的识别能力。结果突出显示了与水产养殖活动和相关无机氮负荷相关的潜在病原体丰度的增加，主要是由于异常干燥的冬季季节中弧菌的富集。该数据库使得基于环境DNA的方法在沿海海洋病原体监测中更具应用价值，有益于全球水资源管理和水产养殖发展。

参考:
Lo, L.S., Liu, X., Liu, H., Shao, M., Qian, P.Y., Cheng, J., (2023). Aquaculture bacterial pathogen database: Pathogen monitoring and screening in coastal waters using environmental DNA. Water Research X, 20, 100194. (impact factor: 9.365)